生工 | 刘嵘明教授团队

发布时间：2026-04-27 作者：

刘嵘明教授团队

【团队简介】

刘嵘明(博士、教授、国家级青年人才)

梁丽亚(博士、副教授、国家级青年人才)

李朋湃(博士、助理教授、大连市青年俊才)

基因编辑与合成生物工程课题组目前有教授1人、副教授1人、助理教授1人、硕博士研究生30余人。团队负责人刘嵘明教授入选国家级青年人才(海外)、辽宁省兴辽英才青年拔尖人才、大连市高端人才、大连市引进中国籍海外高层次人才等称号。发表60余篇国内外学术期刊论文，包括Science、Nature Biotechnology、Nature Communications、Trends in Biotechnology、Advanced Science、Nucleic Acids Research 、Metabolic Engineering等领域内权威期刊，英文专著3篇。申请及授权发明专利10余项、PCT专利5项。

主要的研究方向包括:

①高精度CRISPR基因编辑核酸酶的开发与应用;

②高通量CRISPR基因组编辑工程策略开发与应用;

③细胞工厂的功能预测与智能化设计;

④构建细胞工厂合成生物基化学品、生物燃料以及高附加值产品;

⑤生物信息学工具开发，聚焦于机器学习、深度学习方法在生物分子注释、设计和生成的应用。

【科研展示】

(1) Rongming Liu, et al. Engineering regulatory networks for complex phenotypes in E. coli. Nature Communications, 2020, 11, 4050.

(2) Rongming Liu, et al. Directed evolution of CRISPR/Cas systems for precise gene editing. Trends in Biotechnology, 2020, 39(3): 262-273.

(3) Rongming Liu, et al. Synthetic chimeric nucleases function for efficient genome editing. Nature Communications, 2019, 10, 5524.

(4) Liya Liang, et al. Genome engineering of E. coli for improved styrene production. Metabolic Engineering, 2019, 57: 74-84.

(5) Rongming Liu, et al. Directed combinatorial mutagenesis of Escherichia coli for complex phenotype engineering. Metabolic Engineering, 2018, 47: 10-20.

(6) Rongming Liu, et al. Iterative genome editing of Escherichia coli for 3-hydroxypropionic acid production. Metabolic Engineering, 2018, 47: 303-313.

(7) Rongming Liu, et al. Multiplex navigation of global regulatory networks (MINR) in yeast for improved ethanol tolerance and production. Metabolic Engineering, 2018, 51: 50-58.

(8) Andrew D Garst, Marcelo C Bassalo, Gur Pines, Sean A Lynch, Andrea L Halweg-Edwards, Rongming Liu, Liya Liang, et al. Genome-wide mapping of mutations at single-nucleotide resolution for protein, metabolic and genome engineering. Nature Biotechnology, 2017 35, 48-55.

(9) Pengpai Li, et al. MuToN quantifies binding affinity changes upon protein mutations by geometric deep learning. Advanced Science, 2024, 11(35): 2402918.

(10) Pengpai Li, et al. GeoBind: segmentation of nucleic acid binding interface on protein surface with geometric deep learning. Nucleic Acids Research, 2023, 51(10): e60.

主持项目：

1. 国家级青年人才计划（海外）项目，2022-2024，主持

2. 科技部重点研发专项课题，2024-2028，主持

3. 科技部重点研发专项子课题，2024-2028，主持

4. 国家自然科学基金面上项目, 2023.01-2026.12，主持

5. 国家自然科学基金青年项目, 2023.01-2025.12，主持

6. 辽宁省兴辽英才计划项目，2023-2025，主持

7. 辽宁省自然科学基金项目，2024-2026，主持

8. 大连市科技创新基金项目，2023-2025，主持

9. 中央高校基本科研业务费1, 2022-2023，主持

10. 中央高校基本科研业务费2, 2022-2023，主持

11. 医工交叉项目，2024-2025，主持